La Secretaría de Estado de Medio Ambiente (Sema) es responsable de formular, coordinar e implementar políticas ambientales en Amazonas, además de administrar 42 Unidades de Conservación. En la agenda climática, el departamento ha trabajado para regular los mecanismos de fijación de precios de los servicios ambientales, como el mercado de carbono.
La secretaría también cuenta con el Plan de Prevención y Control de la Deforestación y los Incendios Ilegales que orienta estrategias interinstitucionales para combatir los delitos ambientales. El departamento también es un articulador de cooperación para la agenda ambiental del Estado de Amazonas, junto con gobiernos nacionales e internacionales.